GridMol是一款设计为集分子建模、科学计算、分子信息可视化等为一体的一站式服务型计算化学软件系统。该系统服务器端通过网格中间件高效利用网格中的各种硬件、软件资源,浏览器端提供图形化的计算化学前、后处理功能。GridMol系统基于Java和Java3DAPI设计实现,具有跨平台和网络运行的优点。
GridMol主要包括以下功能:
- 支持多种格式分子文件中分子结构的查看。
- 提供多种模式显示分子的三维结构。
- 显示及修改分子结构参数信息。
- 支持用户创建新的分子模型或根据用户需要对分子模型进行添加/删除原子(基团)、修改分子结构参数等修饰的建模功能,并提供分子结构加氢功能。
- 保存分子结构到多种格式分子文件及图片。
- 提供与高性能计算平台的接口,通过提交表单生成多种计算化学软件的计算输入文件并提交到高性能计算平台进行计算。
- 支持Gaussian软件计算结果文件中的信息处理与可视化功能。通过GridMol软件系统,用户可以方便快捷地完成计算化学研究的前处理过程,进行计算作业提交以及计算结果后处理。
更多信息,请参见 http://gridmol.vlcc.cn/