Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
start [2021/04/28 06:07]
yingjin [Open Library]
start [2024/04/12 08:53] (current)
yingjin
Line 1: Line 1:
-====== Welcome to the Quantum@COSCAR ​======+====== Welcome to the Quantum@CNIC-HPC ​======
 ~~NOTOC~~ ~~NOTOC~~
  
-针对量子体系的计算模拟是中国科学院计科学应用研究中心(COSCAR)的一个重要的研究方向。当前我们自研或者参与研发了多种量子化学、凝聚态物理方面计算软件、分析工具,包括:+针对量子体系的高性能计算模拟是算应用的一个重要的研究方向。当前我们自研或者参与研发了多种量子化学、凝聚态物理方面计算软件、分析工具,包括:
  
   * **[[QC-HILQC|HILQC]]:​** 电子积分函数库 (自研)   * **[[QC-HILQC|HILQC]]:​** 电子积分函数库 (自研)
Line 21: Line 21:
 <HR style="​FILTER:​ alpha(opacity=100,​finishopacity=0,​style=2)"​ width="​100%"​ color=#​987cb9 SIZE=10> <HR style="​FILTER:​ alpha(opacity=100,​finishopacity=0,​style=2)"​ width="​100%"​ color=#​987cb9 SIZE=10>
 </​html>​ </​html>​
 +
 +===== CSIR - CNIC cooperation =====
 +
 +**[[CSIRCNIC|(More details here)]]** ​
  
 ===== Open Library ===== ===== Open Library =====
Line 28: Line 32:
 **[[progress|研究进展]]**: \\ **[[progress|研究进展]]**: \\
  
-  * 并型框架系统+量子叠加态计算与重构的论文[[https://​onlinelibrary.wiley.com/​doi/​10.1002/​jcc.26424|Portably parallel construction of a configuration‐interaction wave function from a matrix–product state using the Charm++ framework]]已在 **J. Chem. Comput.** 杂志正式刊发 {2020.9} +  ​* 计算时间预测的应用文章 
-  * 多态密度泛函理论文章[[https://​pubs.acs.org/​doi/​10.1021/​acs.jctc.0c00208|Variational Multistate Density Functional Theory for a Balanced Treatment of Static and Dynamic Correlations]]已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2020.6} +    * [[基于“AI+HPC”的第一原理计算时间预测及其在社区平台和并行计算中的应用]] 被 HPC China 2021 会议接收,获得期刊推荐资格 {2021.9} \\ 
-  * 多参考ENPT理论文章[[https://​iopscience.iop.org/​article/​10.1088/​2516-1075/​ab72db|Multi-Reference Epstein-Nesbet Perturbation Theory with Density Matrix Renormalization Group Reference Wavefunction]]已在 **Electron. Struct.** 杂志正式出版 {2020.3}\\ ​  +  * 化学多世界理论框架下的DFT计算机时预测文章 
-  * 多组态电子结构+量子信息学文章[[https://​doi.org/​10.1039/​C9CP06417F|Elucidating the Multi-Configuration Character of Firefly Dioxetanone Anion and its prototypes in the Biradical Region using the Full Valence Active Spaces]]已在 **Phys. Chem. Chem. Phys.** 杂志正式刊发 {2020.1} ​ *  +    * [[https://​pubs.acs.org/​doi/​abs/​10.1021/​acsomega.0c04981|Forecasting System of Computational Times of DFT Calculations under the Multiverse ansatz via Machine Learning and Cheminformatics]]已在 **ACS Omega**上正式刊发 {2021.1}\\ 
-  * 程序重构文章[[http://​kns.cnki.net/​kcms/​detail/​detail.aspx?​filename=WLXB202004008&​dbcode=CJFQ&​dbname=CJFDTEMP&​v=|第一性原理软件北京原子技术模拟工具包的重构进展]]在 **物理学报** 杂志正式刊发 {2020.1}\\ +  ​* 并型框架系统+量子叠加态计算与重构的论文 
-  * 化学多世界理论框架下的DFT计算量预测文章[[https:/​/arxiv.org/​abs/​1911.05569|A Forecasting System of Computational Times of DFT Calculations under the Multiverse ansatz via Machine Learning and Cheminformatics]]预印版提交至[[http://​arxiv.org|Arxiv]] {2019.11}\\ +    * [[https://​onlinelibrary.wiley.com/​doi/​10.1002/​jcc.26424|Portably parallel construction of a configuration‐interaction wave function from a matrix–product state using the Charm++ framework]]已在 **J. Chem. Comput.** 杂志正式刊发 {2020.9} 
-  * 激发态梯度文章“[[https://​pubs.acs.org/​doi/​abs/​10.1021/​acs.jctc.9b00969|Analytical gradients and nonadiabatic couplings for the state-average density matrix renormalization group self-consistent field method]]” 已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2019.10}\\ ​  +  * 多态密度泛函理论文章 
-  * OpenMolcas文章"[[https://​pubs.acs.org/​doi/​10.1021/​acs.jctc.9b00532|OpenMolcas:​ From source code to insight]]"​ 已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2019.9}\\ +    * [[https://​pubs.acs.org/​doi/​10.1021/​acs.jctc.0c00208|Variational Multistate Density Functional Theory for a Balanced Treatment of Static and Dynamic Correlations]]已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2020.6} 
-  *  基于DMRG矩阵乘积态波函数的外收缩多参考组态相互作用算法发表在[[https://​pubs.acs.org/​doi/​10.1021/​acs.jctc.8b00613|**J. Chem. Theory Comput.** ​14, 4747 (2018)]]+  * 多参考ENPT理论文章 
 +    * [[https://​iopscience.iop.org/​article/​10.1088/​2516-1075/​ab72db|Multi-Reference Epstein-Nesbet Perturbation Theory with Density Matrix Renormalization Group Reference Wavefunction]]已在 **Electron. Struct.** 杂志正式出版 {2020.3}\\ ​  
 +  * 多组态电子结构+量子信息学文章 
 +    * [[https://​doi.org/​10.1039/​C9CP06417F|Elucidating the Multi-Configuration Character of Firefly Dioxetanone Anion and its prototypes in the Biradical Region using the Full Valence Active Spaces]]已在 **Phys. Chem. Chem. Phys.** 杂志正式刊发 {2020.1} ​ *  
 +  * 程序重构文章 
 +    * [[http://​kns.cnki.net/​kcms/​detail/​detail.aspx?​filename=WLXB202004008&​dbcode=CJFQ&​dbname=CJFDTEMP&​v=|第一性原理软件北京原子技术模拟工具包的重构进展]]在 **物理学报** 杂志正式刊发 {2020.1}\\ 
 +  * 基于DMRG/MPS波函数的激发态梯度求解论 
 +    * [[https://​pubs.acs.org/​doi/​abs/​10.1021/​acs.jctc.9b00969|Analytical gradients and nonadiabatic couplings for the state-average density matrix renormalization group self-consistent field method]]” 已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2019.10}\\ ​  
 +  * OpenMolcas软件开发相关的论 
 +    * [[https://​pubs.acs.org/​doi/​10.1021/​acs.jctc.9b00532|OpenMolcas:​ From source code to insight]]"​ 已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2019.9}\\ 
 +  * 基于DMRG矩阵乘积态波函数的外收缩多参考组态相互作用算法 
 +    * [[https://​pubs.acs.org/​doi/​10.1021/​acs.jctc.8b00613|Externally-Contracted Multireference Configuration Interaction Method Using a DMRG Reference Wave Function]]已在 ​**J. Chem. Theory Comput.** ​杂志正式刊发 {2018.7}
  </​WRAP>​  </​WRAP>​
 <WRAP half column> ​ <WRAP half column> ​
 **[[technique|专业技巧]]**: \\ **[[technique|专业技巧]]**: \\
 +  * [[mpi_molcas|OpenMolcas集群下的编译安装]]\\
   * [[cf_libxc|libxc泛函库使用g++和fortran时的编译与使用]]\\   * [[cf_libxc|libxc泛函库使用g++和fortran时的编译与使用]]\\
   * [[int_gamess|分子轨道下单双电子积分的提取(GAMESS)]] \\   * [[int_gamess|分子轨道下单双电子积分的提取(GAMESS)]] \\
Line 49: Line 65:
   * [[ts_gau|Gaussian过渡态查找(使用QST2,QST3)]]\\   * [[ts_gau|Gaussian过渡态查找(使用QST2,QST3)]]\\
   * {{ :​qc:​opensoucesoftwaresinquantumcomputing-a2.pdf |开源量子计算软件及Qiskit使用入门}}   * {{ :​qc:​opensoucesoftwaresinquantumcomputing-a2.pdf |开源量子计算软件及Qiskit使用入门}}
-</​WRAP>​ 
-</​WRAP>​ 
  
-<WRAP group> 
-<WRAP half column> ​ 
 **HPC & Softwares**: \\ **HPC & Softwares**: \\
 +  * [[tex_autossh|外网访问内网,使用ssh]]
   * [[tec_ld|ld编译问题解决方案一则]] ​   * [[tec_ld|ld编译问题解决方案一则]] ​
   * [[tec_numpy|非root下,python内置numpy版本更新]]   * [[tec_numpy|非root下,python内置numpy版本更新]]
Line 62: Line 75:
   * [[tec_gprof|性能分析工具gprof使用]]   * [[tec_gprof|性能分析工具gprof使用]]
   * [[ins_nwchem1|NWChem源码编译安装,含gcc、openblas、openmpi等]]   * [[ins_nwchem1|NWChem源码编译安装,含gcc、openblas、openmpi等]]
- </​WRAP>​ +
-<WRAP half column> ​+
 **MOLCAS使用入门:** \\ **MOLCAS使用入门:** \\
  
-{{http://​blog.sina.com.cn/​casscf | J-Sagat}}作为MOLCAS开发团队的成员,最近应泰科科技的邀请,制作了MOLCAS软件的入门教程,供参考学习、相互交流。 ​+最近应泰科科技的邀请,制作了MOLCAS软件的入门教程,供参考学习、相互交流。 ​
  
   * {{ :​molcas:​molcas入门教程系列.pdf |Molcas入门教程系列}}   * {{ :​molcas:​molcas入门教程系列.pdf |Molcas入门教程系列}}
Line 79: Line 91:
          <​div style="​height:​ 400px; width: 400px; position: relative;"​ class='​viewer_3Dmoljs'​ data-pdb='​2POR'​ data-backgroundcolor='​0xffffff'​ data-style='​stick'></​div>​          <​div style="​height:​ 400px; width: 400px; position: relative;"​ class='​viewer_3Dmoljs'​ data-pdb='​2POR'​ data-backgroundcolor='​0xffffff'​ data-style='​stick'></​div>​
 </​html>  ​ </​html>  ​
 +
 +京ICP备09112257号-36
 +
 </​WRAP>​ </​WRAP>​
 +
 </​WRAP>​ </​WRAP>​
  
  
  
  • start.1619590079.txt.gz
  • Last modified: 2021/04/28 06:07
  • by yingjin