====== Welcome to the Quantum@CNIC-HPC ======
~~NOTOC~~
针对量子体系的高性能计算模拟是超算应用的一个重要的研究方向。当前我们自研或者参与研发了多种量子化学、凝聚态物理方面计算软件、分析工具，包括：
* **[[QC-HILQC|HILQC]]:** 电子积分函数库 （自研）
* **[[QC-eMC|eMC]]: ** 多组态电子结构程序的主体框架 （自研）
* **[[QC-GridMol|GridMol]]: ** 基于国家网格计算环境的分子片计算系统 （自研）
* **[[QC-NDQC|Kylin]]: ** 南大马海波教授主持的密度矩阵重整化群波函数的量子化学程序包，包含**[[QC-NDQC|EDGA]]**、**[[QC-NDQC|ec-MRCI]]**等特色模块 （参与/合作）
* **[[QC-BDF|BDF]]: ** 北大/山大刘文剑教授主持开发的通用量子化学程序包 （参与）
* **[[FP-BSTATE|BSTATE]]：** 物理所方忠研究组主持开发的第一性原理密度泛函程序包 （参与）
* **[[QC-MSDFT|vMSDFT]]： ** 吉大曲泽星副教授主持开发的变分多态密度泛函（MSDFT）程序包（合作）
===== Open Library =====
**[[progress|研究进展(方法和程序)]]**： \\
* GPU加速的动态电子相关能计算文章
* [[https://dl.acm.org/doi/abs/10.1145/3673038.3673098|PASCI : A Scalable Framework for Heterogeneous Parallel Calculation of Dynamical Electron Correlation]]已在 **ICPP '24:** (Proceedings of the 53rd International Conference on Parallel Processing) 会议正式报道并收录 {2024.8}
* 容错编码 + 机器学习 + 分块激发态计算文章
* [[https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jcc.27459|Fault-tolerant quantum chemical calculations with improved machine-learning models]]已在 **J. Chem. Comput.** 杂志正式刊发 {2024.7}
* GPU加速的约化密度矩阵计算
* [[https://ieeexplore.ieee.org/document/10466870|Efficient Computing for Reduced Density Matrices on GPUs]]已在 **HPCC 23** （ 2023 IEEE International Conference on High Performance Computing & Communications, Data Science & Systems, Smart City & Dependability in Sensor, Cloud & Big Data Systems & Application）会议正式报道并收录 {2024.3}
* 容错编码 + 量子化学计算
* [[https://sioc-journal.cn/Jwk_hxxb/EN/10.6023/A23110496|结合容错编码的量子化学分布式计算]]已在 **化学学报** 杂志正式刊发 {2024.1}
* 多组态/强关联电子结构计算程序Kylin文章
* [[https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jcc.27085|Kylin 1.0: An ab-initio density matrix renormalization group quantum chemistry program]]已在 **J. Chem. Comput.** 杂志正式刊发 {2023.2}
* 机器学习辅助的负载均衡量子化学计算文章
* [[https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jcc.27075|Machine-learning assisted scheduling optimization and its application in quantum chemical calculations]]已在 **J. Chem. Comput.** 杂志正式刊发 {2023.1}
* 化学多世界理论框架下的DFT计算机时预测文章
* [[https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acsomega.0c04981|Forecasting System of Computational Times of DFT Calculations under the Multiverse ansatz via Machine Learning and Cheminformatics]]已在 **ACS Omega**上正式刊发 {2021.1}\\
* 并型框架系统+量子叠加态计算与重构的论文
* [[https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jcc.26424|Portably parallel construction of a configuration‐interaction wave function from a matrix–product state using the Charm++ framework]]已在 **J. Chem. Comput.** 杂志正式刊发 {2020.9}
* 多态密度泛函理论文章
* [[https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.0c00208|Variational Multistate Density Functional Theory for a Balanced Treatment of Static and Dynamic Correlations]]已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2020.6}
* 多参考ENPT理论文章
* [[https://iopscience.iop.org/article/10.1088/2516-1075/ab72db|Multi-Reference Epstein-Nesbet Perturbation Theory with Density Matrix Renormalization Group Reference Wavefunction]]已在 **Electron. Struct.** 杂志正式出版 {2020.3}\\
* 材料/第一原理程序重构文章
* [[http://kns.cnki.net/kcms/detail/detail.aspx?filename=WLXB202004008&dbcode=CJFQ&dbname=CJFDTEMP&v=|第一性原理软件北京原子技术模拟工具包的重构进展]]在 **物理学报** 杂志正式刊发 {2020.1}\\
* 基于DMRG/MPS波函数的激发态梯度求解论文
* [[https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jctc.9b00969|Analytical gradients and nonadiabatic couplings for the state-average density matrix renormalization group self-consistent field method]]” 已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2019.10}\\
* OpenMolcas软件开发相关的论文
* [[https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.9b00532|OpenMolcas: From source code to insight]]" 已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2019.9}\\
* 基于DMRG矩阵乘积态波函数的外收缩多参考组态相互作用算法
* [[https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.8b00613|Externally-Contracted Multireference Configuration Interaction Method Using a DMRG Reference Wave Function]]已在 **J. Chem. Theory Comput.** 杂志正式刊发 {2018.7}
**[[progress|研究进展(应用)]]**： \\
* HPC应用发展综述
* [[基于超级计算机的高性能计算应用发展现状及趋势研究]]被HPCChina24会议接收 {2024.10}
* 储能电池电极材料计算模拟文章
* [[https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2024/qi/d3qi02335d/unauth|Structural and electrochemical properties of Tan+1Cn MXene anode materials for metal-ion batteries]]已在 **Inorg. Chem. Front.** 杂志正式刊发 {2024.4}
* 大活性空间的芳香性分子性质计算
* [[http://cjsc.ac.cn/cms/issues/584|Theoretical study of aromaticity reversal in dimethyldihydropyrene derivatives]]已在 **Chin. J. Struct. Chem.** 杂志正式刊发 {2024.3}
* 计算时间预测的应用文章
* [[https://www.jsjkx.com/CN/10.11896/jsjkx.220100129|基于“AI+HPC”的第一原理计算时间预测及其在社区平台和并行计算中的应用]] 被 [[https://conf.ccf.org.cn/web/html6/index.html?globalId=m8274698689987256321617325790416&type=1|HPC China 2021]] 会议接收,推荐至《计算机科学》 {2022.5} \\
* 多组态电子结构+量子信息学文章
* [[https://doi.org/10.1039/C9CP06417F|Elucidating the Multi-Configuration Character of Firefly Dioxetanone Anion and its prototypes in the Biradical Region using the Full Valence Active Spaces]]已在 **Phys. Chem. Chem. Phys.** 杂志正式刊发 {2020.1} *
** 会议报告 **： \\
* [[ISTCP-2024 ： "Chemical reactions" between HPC/AI and RGs(TBA)]]
* [[中国化学会年会 ： 编码容错的大分子分片计算方法(TBA)]]
* [[APATCC10-2023 ： TBA]]
**[[technique|专业技巧(More by click here)]]**： \\
* [[mpi_molcas|OpenMolcas集群下的编译安装]]\\
* [[cf_libxc|libxc泛函库使用g++和fortran时的编译与使用]]\\
* [[int_gamess|分子轨道下单双电子积分的提取（GAMESS）]] \\
* [[AOint_gamess|原子轨道单双电子积分的提取（GAMESS）]]\\
* [[guga_drt|图形酉群（GUGA）中行列式的构建]]\\
* [[rocm_dgemm|基于ROCm的双精度乘法（dgemm）调用]]\\
* [[map_cpp|C++中Map的使用（牵扯小部分Hash_map和TBB的Hash）]]\\
* [[orth_sym|对称正交化(伪代码)]]\\
* [[ts_gau|Gaussian过渡态查找（使用QST2，QST3）]]\\
* {{ :qc:opensoucesoftwaresinquantumcomputing-a2.pdf |开源量子计算软件及Qiskit使用入门}}
**HPC & Softwares**： \\
* [[tex_autossh|外网访问内网，使用ssh]]
* [[tec_ld|ld编译问题解决方案一则]]
* [[tec_numpy|非root下，python内置numpy版本更新]]
* [[tec_squid|计算集群使用squid代理访问外网]]
* [[tec_vpnc|linux下，解决VPN时无法网络访问]]
* [[tec_ergoSCF|ergoSCF安装，以及configure可能出问题后的解决方案]]
* [[tec_gprof|性能分析工具gprof使用]]
* [[ins_nwchem1|NWChem源码编译安装，含gcc、openblas、openmpi等]]
**MOLCAS使用入门：** \\
最近应泰科科技的邀请，制作了MOLCAS软件的入门教程，供参考学习、相互交流。
* {{ :molcas:molcas入门教程系列.pdf |Molcas入门教程系列}}
* [[molcas_initial|MOLCAS特征介绍及其安装、运行]]\\
* [[molcas_keyword|MOLCAS常用方法及其关键字介绍]]\\
* [[molcas_caspt2|MOLCAS中CASSCF、CASPT2及其参数设置]]\\
* [[molcas_other1|MOLCAS基组外推、结果处理]]\\
* [[molcas_example|MOLCAS更多示例]]\\